メタロドプシン

ecochem2008-05-14

ロドプシンPDBデータをいろいろチェックしていて,見落としていたことに気付いたのが右のアニメ画像のメタロドプシンII構造例1ln6
以下の資料を見てわかるようにバクテリオロドプシンはさておき,all-trans -レチナールが入ったロドプシンのデータはなかなかないのだが,メタロドプシンがキーワードだったわけでNMR測定データなので水素原子まで示されるのがありがたい(ただしなぜかレチナールのH原子がいくつか欠落している)。11-cis -レチナールが入った暗順応時のウシロドプシン1jfpと対応する。


1jfp


メタロドプシンについては以下が参考になる。

ところでロドプシンと言えば膜貫通タンパク質である上に糖鎖を含むデータも多く,有用な教材と言える。
なお,膜貫通タンパク質関連で本ブログでも何回か紹介した以下のサイトのURLが変更になっていたので訂正させていただく。