PDB今月の分子と新ツールKiosk Viewer
月始めの水曜日,RCSB PDBに新規データと今月の分子のチェックに行ったところ,以下のニュース。任意のPDBデータをフルスクリーンのアーティスティックなアニメーションで見せてくれるツールの登場である。イベントのプレゼンテーションに使えそうだ。
サンプルデモで最初に表示されるのはGFPの1kys
ビスフェノールAが結合したエストロゲン関連受容体γの2e2rを表示させた例
(左下に研究者名,右下にリガンド名表示)
今月の分子の方は,
- Molecule of the Month(PDB,2009/08),Sulfotransferases(スルホトランスフェラーゼ)|硫酸転移酵素(PDBj)
あまり馴染みのないタンパク質だが,画像と日本語訳で生体内のはたらきが理解しやすくなっている。以下の図でいろいろな役割を担っていることを知ってほしい。
スルホトランスフェラーゼの例
〔左〕1aquのChain A(17β-エストラジオール含む)
〔中・右〕水酸化PCBを含むエストロゲンスルホトランスフェラーゼの例1g3m(言及ブログ記事)
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※追記(2009/08/05):2009/05/27で取り上げた1Q84をKiosk Viewerで表示してみた。
1Q84