トポロジカルなイソメラーゼ

ecochem2006-01-09

NHKのサイトを見に行ったら,

というのがあって面白ブログを募集していたので早速自薦で応募。アニメgifを売りの1つにしたので,まずは今年初作品を作成(右画像)。元旦にデータベースの仕様が変わったことを紹介したRCSB PDBの連載 Molecule of the Month(今月の分子)の2006年第一弾,トポイソメラーゼ例のPDB 1a36(DNAとの複合体)である。

トポイソメラーゼはトポロジー位相幾何学)とイソメラーゼ(異性化酵素)の合成語と考えればよく,上の参考ページにあるようにDNAがその役割を果たすために鎖の切断・再結合反応などを触媒する。生体高分子は必要に応じてその立体構造等を複雑に変化させる必要があることを教えてくれる分子の一つである。
なお,DNAの形状変化については以下でも取り上げた。