2009/08/13に予告を書いて以来，続報が遅れましたが全体プログラムもDLできるようになりました。 サイエンスアゴラ2009（2009/10/31-11/03，国際研究交流大学村） サイエンスアゴラ2009 プログラム [PDF] 参考：Twitterにおけるサイエンスアゴラ2009情報（ハ…

前回のエントリー（2009/09/27） *1からなんと3週間以上間が空いてしまった。 トップのリンクに [NEW!] を付け，サイドにロゴを置いたままtwitterにしばらく旅に出てしまったような感じである。今話題のツイッター本2冊（続々登場の流れ）， のうち，写真左…

ここ数日の間にwww.ecosciにアップしたデータから。 2009/09/16に記したグリシドール（glycidol）の件， トピック分子（生活環境化学の部屋） へのアクセスをチェックしていたら本ブログやmixi日記からのほかに，以下からのものが多数。 Bingによる“glycidol…

生活環境化学の部屋のアクセス解析をチェックして，サーチエンジン経由の来訪ではキーワードが「ペラミビル」関連の多いことに気付く。早速ニュースを見つけて関連ページに記述を追加した。この記事もその一端。 2009/09/15（21:40時点） 治療薬はタミフル5…

今朝の朝日新聞の天声人語はメタボの話題で，その中に1008/08/29に記したファトスタチン（掲載ページ参照；冒頭画像は再掲）のことが化合物名を記さずに紹介されていた。研究者名が記したので検索すればわかるだろいうという考えもあってカタカナの名称は読…

本ブログ記事， 新刊「分子でよむ環境汚染」はecosci.jpのガイドブック？（2009/05/16） で紹介した本の内容および関連拙作コンテンツと重なる部分が多い以下の雑誌が出た。 雑誌特集『子どもと環境化学物質 ─病が“プログラム”される可能性』，科学，2009年9…

定例のRCSB PDB新規データチェックに標題のタンパク質データが公開されているのを知り，関連情報をチェックしたらちょうど今日以下のニュースが出ていた。データ公開と同じ日にニュースが載るようにしたのだとしたらすごい。actinohivinはまだWikipediaにも…

月始めの水曜日，RCSB PDBに新規データと今月の分子のチェックに行ったところ，以下のニュース。任意のPDBデータをフルスクリーンのアーティスティックなアニメーションで見せてくれるツールの登場である。イベントのプレゼンテーションに使えそうだ。 Turn …

今朝の朝日新聞科学欄に『見えない世界に潜む美 これって科学？ それとも アート？』という記事があり，何枚かの写真が出ていた中に，2009/07/31ほかで紹介した若田光一さんが国際宇宙ステーション（ISS）の実験棟「きぼう」で行ったタンパク質結晶化と関係…

新潟市の職場では曇天が幸いして肉眼観察が可能に（新潟市東区海老ヶ瀬471，11時3分撮影） Googleトップページも今日は日食 その時刻が現代では予告される日食という事象にいろいろなことが想起される。 ◎伝承 NHKの特集番組でも世界各地の伝承が紹介されて…

あまりに長い間被害者を放置してきている水俣病に『第2の政治決着』が図られようとしている。昨年訪れた水俣市の「ほっとはうす」（水俣を歩いて参照）の様子を伝えているブログには以下のように記され，被害者たちの声を伝えるYouTube動画も公開されている…

昨日公開されました。β-セクレターゼはアルツハイマー病のニュースなどにしばしば登場しますが，Wikipedia英語版には記事があるものの日本語版にはまだありません。 Molecule of the Month（PDB，2009/07），beta-Secretase｜β-セクレターゼ（PDBj） アルツ…

2009/06/16（現地時間）のRCSB PDB新規公開データの中にポリフェノールのエピガロカテキンガレート（EGCG）が含まれていたのだが，なかなかPDBsumにリガンド周辺データが示されない。そこで， File upload for PDBsum page generation に，当該データ2kdhを…

サイエンスカフェにいがた第26回『オリュンポスの神々と本をめぐって 〜科学夜話12題24色』（2009/07/17，ジュンク堂書店新潟店） が間近に迫った。お陰で東京からの参加申し込み3名*1を含め予約者数は30名を突破した。この1日には地元紙にお洒落な紹介記事…

今日で松本サリン事件から15年になる。化学物質を悪用するという点で忘れられない事件だ。 社説：松本サリン 風化させぬ決意を共に（信濃毎日，2009/06/27） 松本サリン事件、27日で15年 被害者救済「遅すぎた」（日経，2009/06/27） 本間善夫・川端潤，「パ…

RCSB PDBの2009/06/16付け（現地時間）新規公開データのトップは，プログラム細胞死に関係する生体分子だった。 プログラム細胞死PDCD5のPDBデータ2k6b（トピックス分子で参照可能）※参考：プログラム細胞死 - Wikipedia 『死』と言えば，生体分子のジャンル…

先日「かぐや」*1が月に落下してその役目を終えた。私のがこどものころ最初に持っていた上空に浮かぶ月のイメージは，「アポロ」や「かぐや」などによってどんどん塗り替えられたし，インターネットなどというもので月面の動画が見れるようになるなんて，何…

昨日新規データチェックのためにRCSB PDBに行ったら今月の分子が更新されていた。2009/01/16にも取り上げたヴォールト（ボルト）である。 ヴォールトの部分構造（First entry, chain A-M）2zuo；再掲※トピックス分子（生活環境化学の部屋）に構造掲載 Molecu…

一昨日に記した講演会は参加者が100人に達していなかったようで，最新の話題をもっと多くの方に聴いてほしかったと感じた。サイエンスカフェにいがたのスタッフが2人来ていたのはさすがというところ。 市民公開講座「クラゲの光からのレッスン―GFPと生命科学…

RCSB PDBの定例新規データチェックから。同サイトのデザインが一新され，洗練した感じになりました。 Release of new design, features, and functionality（RCSB PDB，2009/05/26） 新デザインでのデータ表示例3d90※レボノルゲストレル（合成プロゲステロン…

新刊をチェックしていて，発刊前の本が大変な話題になっていることに気付きました。そのタイトルを見た瞬間にPDB IDだと思ってしまったのですから因果なものです。出る前にもはや増刷になっているなど，Google検索でその本のことがたくさん出てきます。 Goog…

新型インフルエンザの感染は広がっているものの，国内における対策は変更になって社会への影響は少し緩和されそう。 新型インフル、休校は季節性と同様 政府が新指針（朝日，2009/05/22） さて今日は体育祭で休講。講義で話すはずだった今朝目にしたニュース…

RCSB PDBの定例新規データチェックから。 まずは標題のバクテリオファージT4の部品gp6。スター型の3h3yとドーム型の3h3wが同時公開された。 スター型の3h3y※対称形生体分子データ集で参照可能（Chime版コンテンツも参照） 研究グループのMichael Rossmann氏…

数日前に以下のニュースを読んで以来，PDBデータ2zyeおよびそのPDBsumデータと格闘してどうにかあれこれ画像を作成することができた。 HIV：増殖させるたんぱく質、中性子線で構造解明−−原子力機構や京都薬科大（毎日，2009/05/11） 日本原子力研究開発機構…

先週記した番組が本日放映され，オープニングとがんの話のところでp53の分子モデル回転画像が数秒登場して画面右上隅には「生活環境化学の部屋」のクレジット表示。 テレビ朝日「大人のソナタ｜第2回 恋は体に良いって本当？」 オリジナルのGIFアニメは以下…

定例のRCSB PDBの新規データチェック，月始めなのでMolecule of the Monthも更新で，時機に合わせてインフルエンザ関連データがピックアップされていた。日本語版の今月の分子（PDBj）の更新は明日以降か。 Molecule of the Month（2009/05） - Influenza Ne…

今年のGWは自宅で仕事三昧。別ブログ（2009/04/18）に書いたように先月米沢に行って満開の桜を見てきたのがよい充電の機会になった。詳しい報告はまた後日として，以下は友人O君が送ってくれた写真の中から上杉公園のお堀の桜。学生時代の通学路だったと思う…

2009/04/26に記した分子画像のNewton掲載に続き，今度はテレビにある生体分子の画像が映ることになりました（内容にはタッチしていません）。先週から始まった新番組で，5/3（晴れれば阪神-巨人戦…）か5/10の放送分になります。「生活環境化学の部屋」の名前…

先ほどお昼のNHKニュースでもトップでしたが。 「人から人に感染」確認 新型豚インフル、米CDC発表（日経，2009/04/25） 豚インフルエンザ：厚労省が情報収集 専門家ら、大流行警戒（毎日，2009/04/25） メキシコで60人死亡 WHO、豚インフルか（47NEWS，2009…

毎週木曜日課でRCSB PDBの2009/04/21付け新規公開データをチェックして1データを追加（3cugをChime版データ集に）。 これとは別に先週公開された2weqが画像では2量体なのに単量体だったものを，PQSで確認したら計算による2量体がすでに出ていたので早速PQSデ…