芳香族アミノ酸識別秀丸マクロ

生体分子

の中に示した芳香族アミノ酸についてWeb検索するといろいろ面白いデータが見つかり，同記事の重みが一層増すように思う。

このセルロース結合モジュールで紹介されているPDBデータ1gwlに記載されていたSITE情報をもとに作成したのが以下の画像。非晶性セルロースをつかまえているアミノ酸のうち，ピラノース環の疎水的部分の近傍には芳香族アミノ酸が位置していることがわかる。


1gwlのSITE部分（全SITE情報のうちBMA近傍だけにしてTyr46追加；黄緑色が芳香族アミノ酸）

上図で表の部分は今回作成した１文字表記のアミノ酸配列（FASTA format）から芳香族アミノ酸を識別表記するための秀丸マクロによるもので，先ほど公開したばかりである。