膜貫通領域予測TMHMM（増えるバイオ関連DB）

昨日届いた本，

• 岡崎康司・坊農秀雅 編，「ゲノム情報はこう活かせ！ 比較ゲノム学を遺伝子・タンパク質の機能解析や疾患遺伝子探索に活用する方法がわかる」，羊土社(2005) …bk1情報

で，この分野のデータベースがさらに増えているのを知り，

• PDB部分データによるコンテンツ集

の末尾リストに少し追加。
2005/04/28で出したPDB収録のロドプシンデータの膜貫通部分は，

• SOSUI WWW Server

を利用して予測したが，上の書籍には2つの膜貫通領域予測サイトが出ていたので，このうち，

• TMHMM

を利用したものを，SOSUIでの結果と比べてみた。

• PDBとSOSUI・TMHMMを利用した演習（要・Chimeインストール）

生体内のネットワークが少しずつ明らかにされるにつれて，データベースの数と内容も急速に増えていくのを実感する。コンテンツ作成のネタが尽きないのは有り難いが，そろそろフォローが厳しくなってきたのも事実…。