Jmolによる高分子の表示

ecochem2006-03-03

ちょっと専門的な話で恐縮。2006/02/07以来書いている新しい分子表示ツールChimeによるコンテンツ,先日は高分子に取り組んだ(右サンプル図はPMMA)。

Jmolの球棒表示では,繰り返し単位の末端に使っている原子種(Lp)の球を小さく表示するので,Chimeのように細工しないでそのまま表示しても違和感がない。ただ,PET(ペットボトルの原料)だけ,何回か座標データを作成しなおしてもベンゼン環の表示が他と異なってしまうのが気になる。
これで,低分子,高分子,生体高分子,分子振動についてJmolの利用に目処がついたというところ。