PDBsumのLigand情報を身近な現象に援用する

今日の講義，

• 講義用トピック（2008年度前期）
  • Googleによる“繊維 分子間力 染料 OR 汚れ”の検索結果 → 染料の種類（生活環境化学の部屋）

の説明のために急遽作成したJmol版データから作成した画像例。

C.I.Basic Blue 9（メチレンブルー）を含むPDBsumデータ2yve - Ligand MBTより
（SITEにはアミノ酸以外にグリセリン含む）
※PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性で分子モデル参照可能
タンパク質と色素の結合データを，タンパク質繊維と染料の結合様式とみなすという粗っぽい発想だが，以下のような模式的な図から考えると格段の進歩とも言えるだろう。

染料以外にもPDBsumのLigand-SITE情報のコレステロールなどは羊毛に付着する疎水性汚れの例とみなすことも可能であろう。