シアル酸と鳥インフルエンザ発生のニュース

一昨日の記事を書いた後,夜中にシアル酸のデータを作らなかったことに気付いて昨日データ作成し,画像も差し替えた。


Ligand-SITE情報データにCleftsデータ(何れもBinding-surface 1)を追加して作成した画像(上段のsurfaceはamino色,下段は酸性・中性・塩基性区別)
〔左〕シアル酸を含む2c4a(Clefts),〔中〕GS4071を含む3cl0(Clefts),〔右〕ザナミビルを含む3ckz(Clefts)
PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性でデータ参照可

なお,上図を掲載したページは以下のイメージ検索で現在トップに表示される!

Googleによる“シアル酸”イメージ検索結果(3009/02/28時点)

また,Cleftsデータ利用開始を記念して,2c4a(Clefts)から回転アニメ画像も作成した。

さらに,以上の図は何れもノイラミニダーゼ中のものだったが,昨日のニュース,

ではH7型のウイルスとのことだったので,先ほどヘマグルチニン中のシアル酸データをPDBsumで探して(他の糖と結合して糖鎖になったものについては掲載例があるが),データ集に追加した。


PDBsumデータ例5hmg_SIAより
※同データにはClefts情報は掲載されていない